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Create a new phylogenetic flow path object (pfp)

Usage

pfp(x = list())

pf_is_pfp(x)

Arguments

x
  • For pfp(): A list of nodes (integer) the path passes through

  • For is_pfp(): An object to test.

Value

A pfp object

Examples

pfp(ape::nodepath(ape::rtree(100)))
#> <pfp[100]>
#>   [1] 101->102->103->104->1                                         
#>   [2] 101->102->103->104->2                                         
#>   [3] 101->102->103->105->106->107->3                               
#>   [4] 101->102->103->105->106->107->4                               
#>   [5] 101->102->103->105->106->108->109->5                          
#>   [6] 101->102->103->105->106->108->109->110->111->6                
#>   [7] 101->102->103->105->106->108->109->110->111->7                
#>   [8] 101->102->103->105->106->108->109->110->112->8                
#>   [9] 101->102->103->105->106->108->109->110->112->9                
#>  [10] 101->102->103->105->106->108->113->114->10                    
#>  [11] 101->102->103->105->106->108->113->114->115->11               
#>  [12] 101->102->103->105->106->108->113->114->115->12               
#>  [13] 101->102->103->105->106->108->113->13                         
#>  [14] 101->102->103->105->116->117->118->14                         
#>  [15] 101->102->103->105->116->117->118->15                         
#>  [16] 101->102->103->105->116->117->119->120->121->16               
#>  [17] 101->102->103->105->116->117->119->120->121->17               
#>  [18] 101->102->103->105->116->117->119->120->122->18               
#>  [19] 101->102->103->105->116->117->119->120->122->123->19          
#>  [20] 101->102->103->105->116->117->119->120->122->123->20          
#>  [21] 101->102->103->105->116->117->119->124->125->21               
#>  [22] 101->102->103->105->116->117->119->124->125->126->22          
#>  [23] 101->102->103->105->116->117->119->124->125->126->23          
#>  [24] 101->102->103->105->116->117->119->124->24                    
#>  [25] 101->102->103->105->116->25                                   
#>  [26] 101->102->127->128->129->26                                   
#>  [27] 101->102->127->128->129->130->131->27                         
#>  [28] 101->102->127->128->129->130->131->28                         
#>  [29] 101->102->127->128->129->130->132->29                         
#>  [30] 101->102->127->128->129->130->132->30                         
#>  [31] 101->102->127->128->133->31                                   
#>  [32] 101->102->127->128->133->134->135->32                         
#>  [33] 101->102->127->128->133->134->135->33                         
#>  [34] 101->102->127->128->133->134->136->34                         
#>  [35] 101->102->127->128->133->134->136->137->138->139->35          
#>  [36] 101->102->127->128->133->134->136->137->138->139->140->36     
#>  [37] 101->102->127->128->133->134->136->137->138->139->140->37     
#>  [38] 101->102->127->128->133->134->136->137->138->38               
#>  [39] 101->102->127->128->133->134->136->137->141->39               
#>  [40] 101->102->127->128->133->134->136->137->141->40               
#>  [41] 101->102->127->142->41                                        
#>  [42] 101->102->127->142->42                                        
#>  [43] 101->143->144->145->146->147->148->43                         
#>  [44] 101->143->144->145->146->147->148->44                         
#>  [45] 101->143->144->145->146->147->45                              
#>  [46] 101->143->144->145->146->149->46                              
#>  [47] 101->143->144->145->146->149->47                              
#>  [48] 101->143->144->145->150->48                                   
#>  [49] 101->143->144->145->150->49                                   
#>  [50] 101->143->144->151->152->50                                   
#>  [51] 101->143->144->151->152->153->154->51                         
#>  [52] 101->143->144->151->152->153->154->52                         
#>  [53] 101->143->144->151->152->153->53                              
#>  [54] 101->143->144->151->155->156->157->54                         
#>  [55] 101->143->144->151->155->156->157->158->159->160->55          
#>  [56] 101->143->144->151->155->156->157->158->159->160->56          
#>  [57] 101->143->144->151->155->156->157->158->159->57               
#>  [58] 101->143->144->151->155->156->157->158->58                    
#>  [59] 101->143->144->151->155->156->59                              
#>  [60] 101->143->144->151->155->161->162->60                         
#>  [61] 101->143->144->151->155->161->162->61                         
#>  [62] 101->143->144->151->155->161->62                              
#>  [63] 101->143->163->63                                             
#>  [64] 101->143->163->164->165->166->167->168->64                    
#>  [65] 101->143->163->164->165->166->167->168->169->65               
#>  [66] 101->143->163->164->165->166->167->168->169->66               
#>  [67] 101->143->163->164->165->166->167->67                         
#>  [68] 101->143->163->164->165->166->170->68                         
#>  [69] 101->143->163->164->165->166->170->69                         
#>  [70] 101->143->163->164->165->171->70                              
#>  [71] 101->143->163->164->165->171->71                              
#>  [72] 101->143->163->164->172->173->174->175->176->72               
#>  [73] 101->143->163->164->172->173->174->175->176->73               
#>  [74] 101->143->163->164->172->173->174->175->177->178->74          
#>  [75] 101->143->163->164->172->173->174->175->177->178->75          
#>  [76] 101->143->163->164->172->173->174->175->177->76               
#>  [77] 101->143->163->164->172->173->174->179->180->77               
#>  [78] 101->143->163->164->172->173->174->179->180->78               
#>  [79] 101->143->163->164->172->173->174->179->79                    
#>  [80] 101->143->163->164->172->173->181->182->80                    
#>  [81] 101->143->163->164->172->173->181->182->81                    
#>  [82] 101->143->163->164->172->173->181->183->184->82               
#>  [83] 101->143->163->164->172->173->181->183->184->185->83          
#>  [84] 101->143->163->164->172->173->181->183->184->185->186->84     
#>  [85] 101->143->163->164->172->173->181->183->184->185->186->187->85
#>  [86] 101->143->163->164->172->173->181->183->184->185->186->187->86
#>  [87] 101->143->163->164->172->173->181->183->188->87               
#>  [88] 101->143->163->164->172->173->181->183->188->189->88          
#>  [89] 101->143->163->164->172->173->181->183->188->189->89          
#>  [90] 101->143->163->164->172->190->191->90                         
#>  [91] 101->143->163->164->172->190->191->91                         
#>  [92] 101->143->163->164->172->190->192->193->92                    
#>  [93] 101->143->163->164->172->190->192->193->93                    
#>  [94] 101->143->163->164->172->190->192->194->195->94               
#>  [95] 101->143->163->164->172->190->192->194->195->95               
#>  [96] 101->143->163->164->172->190->192->194->196->197->96          
#>  [97] 101->143->163->164->172->190->192->194->196->197->198->199->97
#>  [98] 101->143->163->164->172->190->192->194->196->197->198->199->98
#>  [99] 101->143->163->164->172->190->192->194->196->197->198->99     
#> [100] 101->143->163->164->172->190->192->194->196->100