Create a new phylogenetic flow path object (pfp)
pfp.RdCreate a new phylogenetic flow path object (pfp)
Usage
pfp(x = list())
pf_is_pfp(x)Arguments
- x
For
pfp(): A list of nodes (integer) the path passes throughFor
is_pfp(): An object to test.
Examples
pfp(ape::nodepath(ape::rtree(100)))
#> <pfp[100]>
#> [1] 101->102->103->1
#> [2] 101->102->103->2
#> [3] 101->102->104->105->3
#> [4] 101->102->104->105->4
#> [5] 101->102->104->106->107->108->109->5
#> [6] 101->102->104->106->107->108->109->6
#> [7] 101->102->104->106->107->108->110->7
#> [8] 101->102->104->106->107->108->110->8
#> [9] 101->102->104->106->107->111->112->9
#> [10] 101->102->104->106->107->111->112->113->10
#> [11] 101->102->104->106->107->111->112->113->114->11
#> [12] 101->102->104->106->107->111->112->113->114->12
#> [13] 101->102->104->106->107->111->13
#> [14] 101->102->104->106->115->116->14
#> [15] 101->102->104->106->115->116->15
#> [16] 101->102->104->106->115->16
#> [17] 101->117->118->119->120->121->17
#> [18] 101->117->118->119->120->121->122->18
#> [19] 101->117->118->119->120->121->122->123->19
#> [20] 101->117->118->119->120->121->122->123->20
#> [21] 101->117->118->119->120->124->21
#> [22] 101->117->118->119->120->124->125->22
#> [23] 101->117->118->119->120->124->125->23
#> [24] 101->117->118->119->126->127->128->24
#> [25] 101->117->118->119->126->127->128->129->25
#> [26] 101->117->118->119->126->127->128->129->26
#> [27] 101->117->118->119->126->127->130->131->27
#> [28] 101->117->118->119->126->127->130->131->132->28
#> [29] 101->117->118->119->126->127->130->131->132->29
#> [30] 101->117->118->119->126->127->130->133->134->30
#> [31] 101->117->118->119->126->127->130->133->134->31
#> [32] 101->117->118->119->126->127->130->133->32
#> [33] 101->117->118->119->126->135->136->137->138->33
#> [34] 101->117->118->119->126->135->136->137->138->34
#> [35] 101->117->118->119->126->135->136->137->35
#> [36] 101->117->118->119->126->135->136->139->140->36
#> [37] 101->117->118->119->126->135->136->139->140->37
#> [38] 101->117->118->119->126->135->136->139->38
#> [39] 101->117->118->119->126->135->141->142->143->39
#> [40] 101->117->118->119->126->135->141->142->143->40
#> [41] 101->117->118->119->126->135->141->142->41
#> [42] 101->117->118->119->126->135->141->144->145->42
#> [43] 101->117->118->119->126->135->141->144->145->43
#> [44] 101->117->118->119->126->135->141->144->44
#> [45] 101->117->118->146->147->148->149->150->45
#> [46] 101->117->118->146->147->148->149->150->46
#> [47] 101->117->118->146->147->148->149->47
#> [48] 101->117->118->146->147->148->151->152->48
#> [49] 101->117->118->146->147->148->151->152->153->49
#> [50] 101->117->118->146->147->148->151->152->153->154->50
#> [51] 101->117->118->146->147->148->151->152->153->154->155->51
#> [52] 101->117->118->146->147->148->151->152->153->154->155->156->52
#> [53] 101->117->118->146->147->148->151->152->153->154->155->156->53
#> [54] 101->117->118->146->147->148->151->157->158->159->54
#> [55] 101->117->118->146->147->148->151->157->158->159->55
#> [56] 101->117->118->146->147->148->151->157->158->56
#> [57] 101->117->118->146->147->148->151->157->160->161->57
#> [58] 101->117->118->146->147->148->151->157->160->161->58
#> [59] 101->117->118->146->147->148->151->157->160->162->163->59
#> [60] 101->117->118->146->147->148->151->157->160->162->163->60
#> [61] 101->117->118->146->147->148->151->157->160->162->61
#> [62] 101->117->118->146->147->164->165->62
#> [63] 101->117->118->146->147->164->165->63
#> [64] 101->117->118->146->147->164->166->167->168->64
#> [65] 101->117->118->146->147->164->166->167->168->65
#> [66] 101->117->118->146->147->164->166->167->66
#> [67] 101->117->118->146->147->164->166->67
#> [68] 101->117->118->146->169->170->171->172->173->68
#> [69] 101->117->118->146->169->170->171->172->173->174->69
#> [70] 101->117->118->146->169->170->171->172->173->174->175->70
#> [71] 101->117->118->146->169->170->171->172->173->174->175->71
#> [72] 101->117->118->146->169->170->171->172->176->72
#> [73] 101->117->118->146->169->170->171->172->176->177->73
#> [74] 101->117->118->146->169->170->171->172->176->177->74
#> [75] 101->117->118->146->169->170->171->178->179->75
#> [76] 101->117->118->146->169->170->171->178->179->180->76
#> [77] 101->117->118->146->169->170->171->178->179->180->77
#> [78] 101->117->118->146->169->170->171->178->181->78
#> [79] 101->117->118->146->169->170->171->178->181->79
#> [80] 101->117->118->146->169->170->182->183->80
#> [81] 101->117->118->146->169->170->182->183->81
#> [82] 101->117->118->146->169->170->182->82
#> [83] 101->117->118->146->169->184->185->186->83
#> [84] 101->117->118->146->169->184->185->186->187->188->84
#> [85] 101->117->118->146->169->184->185->186->187->188->85
#> [86] 101->117->118->146->169->184->185->186->187->86
#> [87] 101->117->118->146->169->184->185->189->87
#> [88] 101->117->118->146->169->184->185->189->190->88
#> [89] 101->117->118->146->169->184->185->189->190->191->192->89
#> [90] 101->117->118->146->169->184->185->189->190->191->192->90
#> [91] 101->117->118->146->169->184->185->189->190->191->91
#> [92] 101->117->118->146->169->184->193->92
#> [93] 101->117->118->146->169->184->193->194->195->93
#> [94] 101->117->118->146->169->184->193->194->195->94
#> [95] 101->117->118->146->169->184->193->194->95
#> [96] 101->117->196->197->96
#> [97] 101->117->196->197->97
#> [98] 101->117->196->198->199->98
#> [99] 101->117->196->198->199->99
#> [100] 101->117->196->198->100